Coronavirus
Structural Task Force

Kristopher Nolte

Student der Biochemie (B.Sc.)

Kristopher trat dem AK Thorn im Rahmen seiner Bachelorarbeit bei. In dieser Arbeit hat er AUSPEX mit Hilfe maschinellen Lernens verfeinert.

Da aber die Coronakrise unser aller Leben zum Stillstand gebracht hat, trägt er nun zur Task Force bei, indem er seine Kenntnisse der Bioinformatik und Programmierung nutzt, um alle Coronavirus-relevanten Daten aus der PDB zu sammeln, zu organisieren und zu aktualisieren.

Darüber hinaus wird er die Proteine des Virus mithilfe bioinformatischer Werkzeuge untersuchen und seine Ergebnisse auf dieser Website teilen.

Beiträge von Kristopher Nolte

Die Illustration des SARS-COV-2 von Thomas Splettstößer (scistyle.com) imverglich mit dem gedruckten 3D Modell des thornLabs(rechts)

Anleitung: Ein Modell des Coronavirus in 3D

von
Ferdinand Kirsten
am
2020/07/31
Das Coronavirus unkompliziert selbst drucken und zusammenbauen – wir haben ein 3D-Modell dafür entworfen!Abhängig vom User und dem jeweiligen 3D-Drucker sind die Details natürlich unterschiedlich. Die Methoden, die wir angewandt habenkönnen aber als Anhaltspunkt dienen. Nutzer ohne eigenen 3D-Drucker können die STL-Daten aber auch dafür verwenden, den Druck bei einem externen Dienstleister zu beauftragen. Wir […]
SARS-CoV-2 nsp3 Papain-like-protease (PDB-ID:6W9C)

Untangling Nsp3 of SARS-CoV-2

von
Kristopher Nolte
am
2020/08/21
Für diesen Beitrag exisitiert leider keine deutsche Übersetzung. The world holds its breath as the novel Coronavirus continues to spread across the world, bringing our lives to a halt. We have gathered a lot of knowledge about the virus but there are still many gaps to fill. The non-structural-protein 3 (nsp3) represents one of these […]

Untangling nsp3 - Papain-like Protease

von
Kristopher Nolte
am
2020/08/21
Für diesen Artikel steht leider keine deutsche Übersetzung zur Verfügung. An important drug target In the first part of this series we compared the protein nsp3 from SARS-CoV and SARS-CoV-2 by sequence. Now we delve deeper into the differences between these two proteins and follow through by analyzing the structure of one domain of nsp3 […]
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