Coronavirus
Structural Task Force

Coronavirus Blog

Die Illustration des SARS-COV-2 von Thomas Splettstößer (scistyle.com) imverglich mit dem gedruckten 3D Modell des thornLabs(rechts)

Anleitung: Ein Modell des Coronavirus in 3D

von
Ferdinand Kirsten
am
July 31, 2020
Das Coronavirus unkompliziert selbst drucken und zusammenbauen – wir haben ein 3D-Modell dafür entworfen!Abhängig vom User und dem jeweiligen 3D-Drucker sind die Details natürlich unterschiedlich. Die Methoden, die wir angewandt habenkönnen aber als Anhaltspunkt dienen. Nutzer ohne eigenen 3D-Drucker können die STL-Daten aber auch dafür verwenden, den Druck bei einem externen Dienstleister zu beauftragen. Wir […]
Mutation card from the game pandemic. Photo by Andrea Thorn / Coronavirus Structural Taskforce.

The new mutation of SARS-CoV-2

von
Dr. Andrea Thorn
am
December 23, 2020
Leider steht für diesen Artikel keine deutsche Übersetzung zur Verfügung. Introduction It is known as VUI‑202012/01 or B.1.1.7 – the new mutation of the coronavirus Sars-CoV-2. It may be responsible for a sharply increased number of infections in the southeast of England (​1​), however, the scientific results leading to very strict lockdown measurements in the […]
BILD Schlagzeile zu Pressemitteilung

Labor in Wuhan - Stellungnahme zur Pressemitteilung der Uni Hamburg und Prof. Wiesendanger

von
Dr. Andrea Thorn
am
February 19, 2021
“Seit mehr als einem Jahr sorgt das Coronavirus für eine weltweite Krise. In einer Studie hat nun der Nanowissenschaftler Prof. Dr. Roland Wiesendanger den Ursprung des Virus beleuchtet. Er kommt zu dem Ergebnis, dass sowohl die Zahl als auch die Qualität der Indizien für einen Laborunfall am virologischen Institut der Stadt Wuhan als Ursache der […]
Coloured version of a SARS-CoV-2 electrograph.

Woher wissen wir, dass es Viren gibt?

von
Erik Nebelung
am
December 23, 2020
Das SARS-CoV-2 Virus bringt riesige Einschränkungen für uns und unser Leben mit sich. Im krassen Kontrast dazu steht, wie winzig das Virus tatsächlich ist. Diese verschwinden geringe Größe des Virus ist auch das, was unserem Verständnis des Erregers, und damit auch unserer Möglichkeit ihn zu bekämpfen, im Wege steht. In Zeiten von Fake-news, Politikern, die […]
Floating coronavirus SARS-CoV-2

Wie sieht das Coronavirus aus?

von
Dr. Andrea Thorn
am
July 31, 2020
Das Coronavirus ist unsichtbar; man kann es mit bloßem Auge nicht sehen - und das ist ein großes Problem.Wenn ein Haus lichterloh in Flammen steht, dann erkennen wir die Gefahr sehr leicht. Wir würden sofort reagieren: Das Haus verlassen, die Feuerwehr rufen und die Nachbarn warnen. Beim Coronavirus ist die Gefahr leider nicht so klar […]
Protein crystals with polarised light, picture by Andrea Thorn

Wie messen wir makromolekulare Strukturen?

von
Ferdinand Kirsten
am
May 27, 2020
Proteine sind komplexe und empfindliche, große Moleküle (sogenannte Makromoleküle), deren Strukturanalyse uns sehr viel über ihre Funktion verraten kann. Doch die Messung ist komplizierter als man annehmen mag. Man kann nicht einfach einen Blick durch ein Mikroskop werfen, fokussieren und das Protein sehen. Man kann es sich wie das Röntgenbild eines Arms vorstellen, mit dem […]
aspirin tablets

Woher kommen Arzneimittel?

von
Dr. Andrea Thorn
am
April 30, 2020
Früher wurden Arzneimittel zufällig gefunden, und manchmal ist das auch heute noch so. Aber in diesem Artikel geht es um sogenanntes rationales Arzneimitteldesign. Wir fangen an mit zwei wichtigen Begriffen: Wirkstoffe und Targets Die meisten Arzneimittel sind kleinere Moleküle mit bis zu 70 Atomen. Diese Wirkstoffe binden im Körper an das sogenannte Target, ein „Makromolekül“. […]
SARS-COV2 Animated picture. Realistic surface and spike proteins with glycosylation. Image: Thomas Splettstoesser; www.scistyle.com

Der unsichtbare Feind

von
Ferdinand Kirsten
am
April 16, 2020
SARS-CoV-2: Nicht neu, aber anders Das neuartige Coronavirus (SARS-CoV-2 oder 2019-nCoV) ist ein großes Einzelstrang-RNA Virus mit positiver Polarität. Es ist der Familie der Betacoronaviren zugeordnet und zeigt große genetische Ähnlichkeit zu SARS-CoV und MERS-CoV und ist besonders nah verwandt mit dem Bat-SARS-like-CoV (Fledermaus-Coronavirus), von dem es wahrscheinlich auch abstammt. Trotz vieler Gemeinsamkeiten erkennt man, […]
This illustration shows the E protein as a pentameric ion channel embedded in a membrane.

Das E Protein: Kleine Struktur, große Wirkung

von
Luise Kandler
am
August 12, 2020
Überblick Wie die meisten Viren besitzt auch das neuartige Coronavirus SARS-CoV-2 eine schützende Hülle (Envelope), die das wertvolle virale Erbgut umgibt. In dieser Hülle befinden sich verschiedene Strukturproteine, die essentielle Funktionen zur Vermehrung des Virus erfüllen. Ein großer Teil der wissenschaftlichen Forschung konzentriert sich dabei auf das charakteristische Spike-Glykoprotein als therapeutisches Ziel. Doch neben den […]

Volle Kanne nachgefragt: Die vier Postulate des Herrn Koch

von
Dr. Andrea Thorn
am
January 15, 2021
Nach dem Fernsehauftritt heute früh bei ZDF "Volle Kanne" erreichten uns viele Email mit Fragen (und auch ein bisschen Fanpost). Eine dieser Fragen war die Folgende: Sind sie sicher, dass das Virus nach den Koch'schen Postulate isoliert und unter einen Elektronenmikroskop dargestellt werden kann? Könnten sie mir ein Link von dieser sensationellen Studie schicken? Der […]
Picture of corona virus main protease structure with labels.

Die Hauptprotease: Angriffspunkt beim Kampf gegen COVID-19?

von
Sabrina Stäb
am
April 28, 2020
Für die Bekämpfung der Lungenkrankheit COVID-19 und um eine weitere Ausbreitung der Pandemie zu stoppen, ist die Entwicklung neuer Medikamente essenziell. Ein vielversprechendes Angriffsziel für neue Wirkstoffe gegen den Erreger, SARS-CoV-2, ist die 3-Chymotrypsin-like Protease (3CL-protease), auch bekannt als Hauptprotease oder Mpro. Damit neue Viren in der Wirtzelle gebildet werden können, muss die ssRNA des […]
This photograph depicted an Enteric Diseases Laboratory Branch (EDLB), Public Health scientist, who was testing a sample suspected of containing a bacterial toxin. (Picture: CDC | PHIL ID #23165)

Pressemitteilung von Pfizer / BioNTech – zu früh gefreut?

von
Dr. Andrea Thorn
am
November 23, 2020
Die Pressemitteilung Heute haben Pfinzer und BioNTech SE eine Pressemitteilung mit aufregenden Neuigkeiten veröffentlicht. Nachzulesen ist das hier. Selbstredend haben sich die Presseagenturen und News-Outlets auf diese Neuigkeit gestürzt und die Meldung beschert uns Schlagzeilen wie „Meilenstein der Impfung bietet 90% Schutz“ (www.bbc.com, 09.11.2020, 17:00 GTM)„Covid-19-Impfung ist zu 90% wirksam, sagt der Entwickler“ (www.cnn.com, 09.11.2020, […]

Paradox: Viren im Kampf gegen Corona

von
kahoff
am
March 17, 2021
Nach mRNA-Impfstoffen gibt es nun eine weitere Neuheit: Der Vektor-Impfstoff von AstraZeneca enthält ein funktionierendes Virus. Doch wie wirkt er genau? Wo liegen Stärken und Schwächen? Und: Ist er sicher? Die neuartigen mRNA-Impfstoffe gegen SARS-CoV-2 lösen einige Kontroversen aus und die Bedenken sind vielfältig. Die Impfstoffe seien zu wenig getestet worden, man kenne die Langzeitfolgen […]

Sand im Getriebe des Virus: Remdesivir

von
Alexander Matthew Payne and Binisha Karki
am
August 21, 2020
Alexander Matthew Payne und Binisha Karki Einleitung Haben Sie schon gehört, dass das Corona-Virus „mutiert“? Oder dass weltweit „mehr als ein Stamm“ dieses Virus existiert? Das klingt ziemlich erschreckend, nicht wahr? In Wirklichkeit mutiert aber wirklich alles - alle Organismen, angefangen bei Bakterien bis hin zum Menschen, verändern im Laufe der Zeit ihr Erbgut. Dies […]

The Disastrous Life of Nsp15 Endoribonuclease NendoU

von
Dr. Sam Horrell
am
August 21, 2020
Für diesen Beitrag steht leider keine deutsche Übersetzung zur Verfügung. Introduction Before I started writing this article, the first thing I did was to google the name of my protein “NendoU” and was greeted by Figure 1. Needless to say, this is not what I was expecting. So, if you’re an anime fan looking for […]

VIP treatment: Very Important Proteins

von
Lea von Soosten
am
December 7, 2020
Für diesen Beitrag exisitiert leider keine deutsche Übersetzung. This article has been written by Cameron Fyfe and Lea von Soosten. In the previous two articles we spoke of proteins involved in RNA synthesis and proteins involved in removing errors during that process. There are also proteins produced by SARS-CoV-2 that can mimic functions of the host […]

Ein kleines Protein mit großer Wirkung: SARS-7a

von
Sabrina Stäb
am
January 16, 2021
Das Genom von SARS-CoV-2 codiert für ein langes Polyprotein ORF1a/ ORF1ab (ORF = offener Leserahmen). Es umfasst 16 nicht-strukturelle und vier strukturelle Proteine. Durch Leserasterverschiebungen (Engl: „Frame Shifts“) entstehen zusätzliche ORFs, die für sogenannte akzessorische Proteine codieren. Diese Gruppe von Proteinen steht im Verdacht einen großen Beitrag an der Pathogenese von SARS-CoV-2 zu leisten. Man […]
SARS-CoV-2 nsp3 Papain-like-protease (PDB-ID:6W9C)

Untangling Nsp3 of SARS-CoV-2

von
Kristopher Nolte
am
August 21, 2020
Für diesen Beitrag exisitiert leider keine deutsche Übersetzung. The world holds its breath as the novel Coronavirus continues to spread across the world, bringing our lives to a halt. We have gathered a lot of knowledge about the virus but there are still many gaps to fill. The non-structural-protein 3 (nsp3) represents one of these […]

Untangling nsp3 - Papain-like Protease

von
Kristopher Nolte
am
August 21, 2020
Für diesen Artikel steht leider keine deutsche Übersetzung zur Verfügung. An important drug target In the first part of this series we compared the protein nsp3 from SARS-CoV and SARS-CoV-2 by sequence. Now we delve deeper into the differences between these two proteins and follow through by analyzing the structure of one domain of nsp3 […]

To Model, or Not to Model? That is the Question

von
Dr. Sam Horrell
am
August 21, 2020
Für diesen Artikel exisitiert leider keine deutsche Übersetzung. Crystallography has a problem. Some amino acid side chains in our structures simply can’t be seen in our maps (Fig. 1). Crystallographic maps represent many protein molecules in a crystal lattice, thousands of copies of the same molecule averaged over measurement time and unit cells. So, what […]

Spike Glycoprotein: Corona’s Key for Invasion

von
Sabrina Stäb
am
August 21, 2020
Für diesen Beitrag exisitiert leider keine deutsche Übersetzung. COVID-19 is caused by the new coronavirus SARS-CoV-2. This virus has a characteristic virus hull featuring surface proteins which are commonly called “spikes”. Protruding from the viral hull like “spikes of a crown”, they give the coronavirus its name (corona = crown).  These proteins make the first […]
surface_6vxs

Wie stellt man so große Moleküle dar?

von
Ferdinand Kirsten
am
April 9, 2020
Form folgt Funktion Proteine sind große Moleküle, die aus 400 bis 20.000 Atomen bestehen können. Sie sind die Arbeitstiere der lebendigen Welt – Proteine verarbeiten Nahrung, bauen Muskeln, organisieren Zellteilung und Zellunterteilung und sie bilden Haut und Haare. Ihre Grundbausteine sind Aminosäuren, die eine lange Kette bilden. Diese Kette wird durch komplexe Faltung und Verknüpfung […]
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